2009年，国家推出进一步的医疗改革方案，同时开始实施“百万贫困白内障患者复明工程”，为了支持和参与国家的医疗改革，进一步加强基层医院的扶贫治盲能力，健康快车逐步在其服务过的欠发达地区的基地医院建立“健康快车眼科中心”。
健康快车通过与国内多所眼科领域高水平的医院合作，成立相应的专家指导组，设计和组织相应的培训课程，培训基层的眼科医生。同时通过向基地医院赞助白内障手术治疗设备，使其能独立进行白内障手术。“健康快车眼科中心”将在当地留下一列不走的健康快车，持续救治更多贫困的白内障病人。 (根据工作需要，15所“健康快车眼科显微手术培训中心”也并入眼科中心）。
健康快车对基地医院眼科医生的培训分为四个阶段：1、北京集中授课阶段（一周）；2、上健康快车服务实习阶段（三个月）；3、北京白内障手术培训中心强化实习阶段（一个月）；4、培训后工作中的专家扶持阶段（一年）。受训医生在培训每个阶段结束后接受统一考核，完成四个阶段培训并且考核合格后的眼科医师可以在其医院独立开展白内障手术。 眼科中心建成后，每年需完成扶贫白内障手术200例以上。
